一项大型多民族研究发现了长期covid的遗传风险因素

2024-11-06 17:32来源:本站编辑

新的研究揭示了特定的基因变异与慢性疾病的关系nic有限公司抑郁症和纤维肌痛等疾病增加了长期covid的风险,为潜在的治疗方法提供了见解。

*重要提示:medRxiv发布的初步科学报告未经同行评议,因此不应被视为结论性、指导临床实践/健康相关行为,也不应被视为既定信息。

在最近上传至medRxiv预印本*服务器的一篇研究论文中,23andme的研究人员对全基因组关联研究(GWAS)进行了最大规模的荟萃分析,该研究包括来自不同种族背景的17.4万多名参与者,包括欧洲人、拉丁裔和非洲裔美国人,以确定显示长冠状病毒风险增加的遗传位点或表型特征。

研究结果显示,HLA-DQA1-HLA-DQB1、ABO和BPTF-KPAN2-C17orf58这三个特定遗传位点和三种表型的风险显著增加,突出了对这种知之甚少的疾病进行干预的高优先级人群。

背景

新冠肺炎的症状各不相同,包括脑雾和运动后反应等神经系统问题在精神或身体努力后恶化的一种疾病

长冠状病毒是指在感染严重急性呼吸道综合征-冠状病毒-2 (SARS-CoV-2)存活后持续数月甚至数年的2019年冠状病毒病(COVID -like)样症状。

据估计,10-80%的COVID幸存者患有这种疾病,其症状包括严重疲劳、认知“脑雾”和持续呼吸困难。

新冠肺炎确诊患者已超过6500万人。不幸的是,尽管最近的全基因组关联研究提供了对支持急性SARS-CoV-2感染的免疫反应的理解,但对导致长covid的生物学和风险因素知之甚少。

长期covid是一种多器官疾病,一些患者报告了多种通常不相关的症状,这使旨在验证自身免疫反应、病毒载量和炎症在长期covid发病率中的作用的研究复杂化。

流行病学调查已经确定了长期covid发生与人群表型之间的联系,表明先前存在的疾病可能会增加长期covid风险。该研究确定了与长期covid相关的13种表型,包括慢性疼痛、慢性疲劳和纤维肌痛,它们具有不同的关联强度。

利用大型、多种族全基因组关联研究(GWAS)数据集提供了一种方法来检验这一假设,同时进一步允许识别高风险的遗传易感性(位点)。

一个关于这项研究

本研究利用来自23andMe数据库的广泛基因型数据(n = 174,432),涵盖不同种族背景,以确定长期covid风险增加的遗传变异,并阐明在疾病易感性方面具有相似层次的表型集群。

此外,它还采用孟德尔随机化模型来探索遗传和表型(例如COVID-19严重程度)之间的因果关系,以及它们在确定COVID-19幸存者长期COVID-19风险方面的综合影响。

研究参与者是从记录COVID-19确诊幸存者的在线存储库中确定的。通过电子邮件邀请潜在的参与者,并要求他们提供人口统计、社会行为和健康特征。

研究表明,疫苗接种降低了发生长冠状病毒的可能性,但并不能消除它。

此外,从参与者或之前的23andMe出版物中获得了关于参与者年龄、性别、慢性病、教育水平和健康行为(吸烟和饮酒)的详细医疗报告。

未被医学诊断为SARS-CoV-2感染的参与者或在招募前三个月内报告首次感染COVID-19的参与者被排除在研究队列之外。

参与者基因分型由美国实验室公司使用唾液来源的DNA进行,数据用于参与者遗传血统分类(隐马尔可夫模型[HMM]分类器)和GWAS位点表征。

所有分析分别针对每个遗传血统类别(欧洲人、拉丁人、非裔美国人)进行。根据人类白细胞抗原(HLA)输入的等位基因相似性对鉴定出的遗传变异进行聚类,并进行年龄和性别调整的逻辑回归以确定与长covid的关联。

最后,使用双样本孟德尔随机化(MR)计算表型和长冠状病毒之间的遗传因果关系。该研究还探讨了更具体的“长期covid影响”表型,重点关注长期covid严重影响日常生活活动的病例。

研究结果

最初的数据库筛选显示,332,638名COVID-19幸存者,其中179,167人符合研究纳入标准,并被纳入后续分析。

大多数参与者被确定为欧洲血统(78.9%),兰提克斯人(16.6%)和非洲裔美国人(4.5%)组成其他种族队列。

来自其他祖先群体的参与者被排除在进一步的分析之外,因为样本量不足,无法进行稳健的统计分析。

长期covid(病例)和非长期covid(对照)幸存者之间的比较显示,与男性和使用烟草的同行相比,女性(66.7%)和非烟草消费者(37%)更有可能患上这种疾病。

在调整协变量(年龄、血统、性别)后,与对照组相比,先前存在的高血压(优势比[OR] = 1.52)、抑郁症(OR = 1.98)、自身免疫性疾病(OR = 1.55)和心脏代谢疾病(OR = 1.60)在病例中更常见。

使用约1.1亿个输入遗传变异的GWAS分析显示,在所有三个祖先队列中,三个不同的位点- hla - dqa1 - hla - dqb1, ABO和bptf - kpan2 - c17orf58 -与长covid显着相关。此外,发现rs78794747变异在欧洲血统的参与者中很重要。

值得注意的是,对表型与长期covid关联的分析显示,13种表型具有不同的关联强度,慢性疼痛、慢性疲劳和纤维肌痛是观察到的最常见的共现现象。由于慢性疼痛是参与者提供的,非特异性的23andMe数据库定义,因此它被排除在MR建模之外。

结论

本研究利用了迄今为止在长期covid调查中使用的最大的多种族GWAS数据集,并提供证据表明,具有慢性疲劳、抑郁和纤维肌痛遗传倾向以及其他表型(如自身免疫性疾病和心脏代谢疾病)的个体患长期covid的风险明显高于没有这些疾病的个体。

该研究的两层方法侧重于一般的长- covid和更严重的“长- covid影响”表型,有助于完善我们对长- covid更广泛和更衰弱形式的理解。

由于这些情况也导致COVID-19感染后住院的可能性更高,因此它证实了有关住院COVID-19患者长期COVID-19率较高的报告。

*重要提示:medRxiv发布的初步科学报告未经同行评议,因此不应被视为结论性、指导临床实践/健康相关行为,也不应被视为既定信息。

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