预测神经发育障碍的遗传诊断

2024-11-06 17:48来源:本站编辑

新研究确定了运动延迟和假相Nia作为基因诊断的关键预测因子,为指导临床医生进行神经发育护理提供了实用的工具。

在最近发表在《医学遗传学》上的一项研究中,一组研究人员确定了与神经发育障碍(NDD)(影响大脑发育,导致认知或运动迟缓)患者的遗传诊断相关的临床因素,并开发了一种指导基因检测决策的决策工具。

背景

整体发育迟缓、自闭症谱系障碍(ASD)(通过重复行为影响社会互动和沟通)和智力残疾等非发育障碍具有显著的遗传遗传性。

基因检测的进步,包括染色体微阵列(CMA)和外显子组测序(ES),提高了诊断率。在CMA中,10%至20%的病例中发现了遗传变异,而在ES中,这一比例超过40%。

研究表明,患有遗传诊断的个体通常有更多的医学合并症。需要进一步的研究来验证决策工具,并确定额外的表型因素,以提高不同临床人群的遗传诊断准确性。

一个关于这项研究

在本研究中,110名患者及其法定监护人为前瞻性临床数据收集提供了知情同意。此外,在机构审查委员会(IRB)批准的豁免下,对206例患者的图表进行了回顾性审查。

从加州大学洛杉矶分校(UCLA)的电子健康记录中手动提取所有患者的数据,并将其编码到加密数据库中。70名患者因基因检测不完整或缺乏保险授权而被排除在外。

如果患者患有已知或疑似神经遗传疾病,并已完成至少一项基因检测,如CMA、脆性X检测、线粒体脱氧核糖核酸(DNA)检测、单基因测序或ES,则纳入患者。

该研究根据基因检测结果创建了三个队列:致病性或可能致病性(P/LP)、阴性和es阴性子集。临床数据,包括里程碑年龄、运动和语言迟缓史、先天性心脏病和其他因素,被提取并编码以供分析。

统计分析以χ2检验和双样本Wilcoxon检验开始,探讨临床变量与遗传诊断之间的关系。随后,使用逻辑回归、分类和回归树(CART)分析来确定与遗传诊断最密切相关的临床特征。

研究结果

该研究队列包括2014年1月1日至2019年1月1日期间转入加州大学洛杉矶分校自闭症神经遗传学研究和治疗中心(CARING)诊所的246名患者,该中心是一家多学科学术卫生系统诊所。

转诊来自学术系统内外的医生、患者权益团体、研究报告和家庭的自我转诊。

参与研究的所有患者都完成了至少一次基因检测,结果可在他们的电子健康记录(EHR)中获得。在246名患者中,153名患者在转诊前接受了基因检测,47名患者在转诊前后都接受了一些检测,46名患者在转诊后完成了所有检测。

246例患者中,152例(61.8%)发现P/LP变异,94例(38%)发现无变异、良性变异或不确定意义变异(VUS)。P/LP队列包括62种不同的遗传诊断,其中12种复发诊断由两个或更多患者共享,而50种诊断是个体患者独有的。

阴性队列接受了各种测试,最常见的是对76名患者进行了CMA。阴性队列中的33例患者也接受了ES,并作为更严格的阴性对照组。

P/LP变异的患者更有可能是女性(47%,阴性组和es阴性组分别为20%和12%)。整个研究组的平均发病年龄为9.4岁,三个队列的年龄没有显著差异。

各组之间的种族或民族分布没有实质性差异,白人患者是主要群体。

逻辑回归分析确定了与P/LP变异可能性较高相关的几个患者特征。与没有运动迟缓的患者相比,有运动迟缓史的患者P/LP变异的几率显著增加。

其他与风险增加相关的因素包括先天性心脏病、低张力和早期干预。每延迟行走一个月,P/LP变异的可能性增加5%至11%。与es阴性组相比,语言延迟史也与P/LP变异相关。

通过CART分析,该研究发现运动延迟是基因诊断的主要预测因素,正确分类了75%的P/LP变异患者。其他因素,如行走年龄、张力不足和初次评估时的年龄,进一步提高了分类的准确性。

结论

总而言之,本研究证实运动延迟、女性和张力过低与遗传诊断的可能性增加密切相关。每延迟行走一个月,致病性或可能致病性变异的可能性增加5%至11%。

先天性心脏病也与基因诊断有关,但癫痫没有,可能是由于样本特征。最后,CART分析显示运动迟缓和肌张力过低是基因检测的有用筛选因素。

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